科学家研发出可用于高分辨率空间转录组学的细胞分割方法—小柯机器人—科学网

2023-11-22 13:24:00
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用于高分别率空间转录组学的细胞盘据(SCS)形式,这一成就由美邦卡内基梅隆大学Ziv Bar-Joseph考虑团队过程不懈悉力而获得。合联论文于2023年7月10日揭晓正在《自然形式学》杂志上。

考虑职员提出了亚细胞空间转录组学细胞盘据,它将成像数据与测序数据相团结,以提升细胞盘据的切确性。SCS 通过行使神经收集自顺应练习为每个点完婚相对付其细胞核心的地位,从而实现细胞黑点分拨。考虑职员正在两种新的亚细胞空间转录组学时间中对SCS举行了测试,其优于古板的基于图像的盘据形式。SCS具有更高的切确性,可识别更众的细胞,并供给了更的确的细胞巨细测算。行使 SCS 点分拨对 RNA 举行亚细胞分解可供给相合 RNA 定位的讯息,并进一步援救盘据结果。

考虑职员吐露,空间转录组学可晋升人们对构制布局和细胞间互相影响的融会。固然目前人人半空间转录组学平台仅能供给众细胞分别率的结果,每个点网罗10-15个细胞,但迩来的时间可得回更繁茂的黑点地位,从而抵达了亚细胞分别率。这些新形式面对的一个环节挑衅是细胞盘据和细胞黑点的分拨。古板基于图像的盘据形式受到局部,不行足够运用空间转录组学所分解的讯息。

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